Атри: Мои дорогие моменты

В будущем, из-за внезапного повышения уровня моря, большая часть человечества оказалась под водой, включая Нацуки Икаруга, молодого человека, который потерял свою мать и ногу из-за несчастного случая. Разочарованный жизнью в большом городе, он возвращается в свою старую деревню и обнаруживает, что его дом наполовину затоплен. Оставшись без семьи и с долгами своей бабушки-ученой, у Нацуки есть только корабль и подводная лодка.

Кэтрин, подозрительная коллекционерка долгов, предлагает ему шанс вернуть свои мечты о будущем, исследуя затонувшие руины лаборатории его бабушки. Вместо сокровищ, они обнаруживают странную девушку по имени Атри, которая выглядит как человек, но оказывается роботом. В благодарность за свое спасение, она предлагает Нацуки свою помощь в любых начинаниях.